MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	TCT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288662
2	NC_011249	A	9	9	106	114	100 %	0 %	0 %	0 %	203288662
3	NC_011249	ACTATC	2	12	117	128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288662
4	NC_011249	TATT	2	8	186	193	25 %	75 %	0 %	0 %	203288662
5	NC_011249	A	7	7	198	204	100 %	0 %	0 %	0 %	203288662
6	NC_011249	ATT	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288662
7	NC_011249	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
8	NC_011249	A	6	6	247	252	100 %	0 %	0 %	0 %	203288662
9	NC_011249	ACT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288662
10	NC_011249	AT	3	6	288	293	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
11	NC_011249	TAT	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288662
12	NC_011249	GTAA	2	8	388	395	50 %	25 %	25 %	0 %	203288662
13	NC_011249	AGT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288662
14	NC_011249	TTA	2	6	431	436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288662
15	NC_011249	T	6	6	481	486	0 %	100 %	0 %	0 %	203288662
16	NC_011249	AT	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
17	NC_011249	TATT	2	8	1055	1062	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
18	NC_011249	GTT	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288663
19	NC_011249	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288663
20	NC_011249	T	6	6	1131	1136	0 %	100 %	0 %	0 %	203288663
21	NC_011249	TTTA	2	8	1187	1194	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
22	NC_011249	AGC	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288663
23	NC_011249	ACC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288663
24	NC_011249	CCT	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288663
25	NC_011249	ATC	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288663
26	NC_011249	CAG	3	9	1357	1365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288663
27	NC_011249	CAC	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288663
28	NC_011249	TGT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288663
29	NC_011249	GATT	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	203288663
30	NC_011249	T	8	8	1496	1503	0 %	100 %	0 %	0 %	203288663
31	NC_011249	CTT	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288663
32	NC_011249	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288663
33	NC_011249	TGC	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288663
34	NC_011249	CAA	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288663
35	NC_011249	TAA	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288663
36	NC_011249	CAA	2	6	1729	1734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288663
37	NC_011249	TCT	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288663
38	NC_011249	T	7	7	1843	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	203288663
39	NC_011249	CAT	4	12	1988	1999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288663
40	NC_011249	CAT	4	12	2003	2014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288663
41	NC_011249	ACT	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288663
42	NC_011249	CTT	2	6	2041	2046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288663
43	NC_011249	T	6	6	2045	2050	0 %	100 %	0 %	0 %	203288663
44	NC_011249	TTC	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288663
45	NC_011249	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288664
46	NC_011249	TTG	2	6	6138	6143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288664
47	NC_011249	TCT	2	6	6175	6180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288664
48	NC_011249	CCT	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288664
49	NC_011249	ATT	2	6	6247	6252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288664
50	NC_011249	TGC	2	6	6282	6287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288664
51	NC_011249	AGC	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
52	NC_011249	T	6	6	6390	6395	0 %	100 %	0 %	0 %	203288664
53	NC_011249	CAT	2	6	6398	6403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288664
54	NC_011249	TCTT	2	8	6430	6437	0 %	75 %	0 %	25 %	203288664
55	NC_011249	AGC	3	9	6438	6446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
56	NC_011249	CAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
57	NC_011249	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
58	NC_011249	AT	3	6	6524	6529	50 %	50 %	0 %	0 %	203288664
59	NC_011249	TGC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288664
60	NC_011249	CAG	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
61	NC_011249	T	6	6	6627	6632	0 %	100 %	0 %	0 %	203288664
62	NC_011249	GTAGCA	2	12	6652	6663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288664
63	NC_011249	ACA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288664
64	NC_011249	CAG	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
65	NC_011249	AGC	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
66	NC_011249	CAG	3	9	6761	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
67	NC_011249	GCA	2	6	6772	6777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288664
68	NC_011249	ATC	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288664
69	NC_011249	CTT	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288664
70	NC_011249	CTTC	2	8	6926	6933	0 %	50 %	0 %	50 %	203288664
71	NC_011249	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288664
72	NC_011249	CAT	3	9	7116	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288664
73	NC_011249	CAT	4	12	7128	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288664
74	NC_011249	ACT	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288664
75	NC_011249	T	6	6	7170	7175	0 %	100 %	0 %	0 %	203288664
76	NC_011249	ATTC	2	8	7182	7189	25 %	50 %	0 %	25 %	203288664
77	NC_011249	ATCT	2	8	8970	8977	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
78	NC_011249	T	6	6	8993	8998	0 %	100 %	0 %	0 %	203288665
79	NC_011249	CTTT	2	8	9021	9028	0 %	75 %	0 %	25 %	203288665
80	NC_011249	T	6	6	9056	9061	0 %	100 %	0 %	0 %	203288665
81	NC_011249	TCT	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288665
82	NC_011249	TAA	2	6	9082	9087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288665
83	NC_011249	TTTA	2	8	9088	9095	25 %	75 %	0 %	0 %	203288665
84	NC_011249	CTG	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288665
85	NC_011249	TGTCAT	2	12	9126	9137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203288665
86	NC_011249	TAT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288665
87	NC_011249	CCT	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288665
88	NC_011249	CTG	3	9	9198	9206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288665
89	NC_011249	CAG	2	6	9219	9224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288665
90	NC_011249	CCT	2	6	9245	9250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288665
91	NC_011249	TCCT	2	8	9310	9317	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
92	NC_011249	ATT	2	6	9326	9331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288665
93	NC_011249	TC	3	6	9345	9350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
94	NC_011249	CACT	2	8	9351	9358	25 %	25 %	0 %	50 %	203288665
95	NC_011249	TTA	2	6	9437	9442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288665
96	NC_011249	ATT	2	6	9448	9453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288665
97	NC_011249	CTG	2	6	9462	9467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288665
98	NC_011249	TTC	2	6	9542	9547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288665
99	NC_011249	CT	3	6	9554	9559	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
100	NC_011249	CTA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288665
101	NC_011249	CCT	2	6	9660	9665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288665
102	NC_011249	TTGCT	2	10	9729	9738	0 %	60 %	20 %	20 %	203288665
103	NC_011249	T	9	9	9812	9820	0 %	100 %	0 %	0 %	203288665
104	NC_011249	CAT	2	6	9907	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288665
105	NC_011249	TCC	3	9	9937	9945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288665
106	NC_011249	CTC	2	6	9963	9968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288665
107	NC_011249	CAT	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288665
108	NC_011249	CAT	4	12	9991	10002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288665
109	NC_011249	AAT	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288665
110	NC_011249	T	6	6	10033	10038	0 %	100 %	0 %	0 %	203288665
111	NC_011249	ATTC	2	8	10045	10052	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
112	NC_011249	ATTA	2	8	10262	10269	50 %	50 %	0 %	0 %	203288666
113	NC_011249	TC	3	6	10301	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	203288666
114	NC_011249	TTAT	2	8	10315	10322	25 %	75 %	0 %	0 %	203288666
115	NC_011249	GAT	2	6	10396	10401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288666
116	NC_011249	CTTCTG	2	12	10415	10426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288666
117	NC_011249	AGC	2	6	10434	10439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288666
118	NC_011249	ATC	2	6	10440	10445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288666
119	NC_011249	TCTT	2	8	10510	10517	0 %	75 %	0 %	25 %	203288666
120	NC_011249	CTG	2	6	10520	10525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288666
121	NC_011249	AGT	2	6	10536	10541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288666
122	NC_011249	TGC	2	6	10587	10592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288666
123	NC_011249	GAA	2	6	10640	10645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288666
124	NC_011249	CACT	2	8	10655	10662	25 %	25 %	0 %	50 %	203288666
125	NC_011249	GCT	2	6	10684	10689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288666
126	NC_011249	TCT	2	6	10699	10704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288666
127	NC_011249	T	7	7	10742	10748	0 %	100 %	0 %	0 %	203288666
128	NC_011249	TCA	2	6	10756	10761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288666
129	NC_011249	CTA	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288666
130	NC_011249	TTA	2	6	10847	10852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288666
131	NC_011249	CAG	2	6	10883	10888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288666
132	NC_011249	GCT	2	6	10936	10941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288666
133	NC_011249	TAA	2	6	10979	10984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288666
134	NC_011249	ACT	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288666
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